Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR1BP22528 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPRR1BP22528 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRR1BP22528 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR1BP22528 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms