Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFNA1P20827 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFNA1P20827 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFNA1P20827 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFNA1P20827 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNA1P20827 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFNA1P20827 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFNA1P20827 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFNA1P20827 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EFNA1P20827 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFNA1P20827 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFNA1P20827 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFNA1P20827 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNA1P20827 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNA1P20827 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNA1P20827 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNA1P20827 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNA1P20827 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EFNA1P20827 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EFNA1P20827 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms