Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF1BP20333 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF1BP20333 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF1BP20333 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF1BP20333 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF1BP20333 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF1BP20333 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF1BP20333 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF1BP20333 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF1BP20333 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF1BP20333 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF1BP20333 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF1BP20333 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF1BP20333 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF1BP20333 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF1BP20333 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF1BP20333 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF1BP20333 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF1BP20333 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF1BP20333 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF1BP20333 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF1BP20333 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF1BP20333 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF1BP20333 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFRSF1BP20333 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF1BP20333 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF1BP20333 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF1BP20333 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF1BP20333 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFRSF1BP20333 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFRSF1BP20333 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.5 ms