Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL2P19875 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL2P19875 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCL2P19875 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL2P19875 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL2P19875 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCL2P19875 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL2P19875 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL2P19875 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL2P19875 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL2P19875 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCL2P19875 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL2P19875 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCL2P19875 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL2P19875 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL2P19875 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCL2P19875 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL2P19875 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL2P19875 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCL2P19875 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCL2P19875 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL2P19875 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL2P19875 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCL2P19875 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL2P19875 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL2P19875 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCL2P19875 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL2P19875 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL2P19875 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL2P19875 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCL2P19875 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCL2P19875 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL2P19875 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CXCL2P19875 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL2P19875 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL2P19875 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CXCL2P19875 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL2P19875 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL2P19875 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL2P19875 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms