Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ATF3P18847 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ATF3P18847 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ATF3P18847 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ATF3P18847 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ATF3P18847 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ATF3P18847 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ATF3P18847 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ATF3P18847 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ATF3P18847 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATF3P18847 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATF3P18847 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATF3P18847 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATF3P18847 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATF3P18847 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATF3P18847 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ATF3P18847 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ATF3P18847 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ATF3P18847 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ATF3P18847 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ATF3P18847 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ATF3P18847 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ATF3P18847 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ATF3P18847 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ATF3P18847 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ATF3P18847 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ATF3P18847 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ATF3P18847 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ATF3P18847 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ATF3P18847 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ATF3P18847 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ATF3P18847 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ATF3P18847 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATF3P18847 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATF3P18847 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATF3P18847 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATF3P18847 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ATF3P18847 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ATF3P18847 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATF3P18847 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATF3P18847 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATF3P18847 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATF3P18847 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ATF3P18847 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ATF3P18847 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ATF3P18847 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ATF3P18847 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ATF3P18847 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATF3P18847 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ATF3P18847 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ATF3P18847 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATF3P18847 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATF3P18847 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATF3P18847 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF3P18847 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF3P18847 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF3P18847 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF3P18847 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF3P18847 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF3P18847 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF3P18847 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF3P18847 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF3P18847 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF3P18847 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF3P18847 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATF3P18847 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ATF3P18847 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ATF3P18847 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
ATF3P18847 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ATF3P18847 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ATF3P18847 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ATF3P18847 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ATF3P18847 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ATF3P18847 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ATF3P18847 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
ATF3P18847 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ATF3P18847 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATF3P18847 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATF3P18847 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ATF3P18847 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ATF3P18847 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ATF3P18847 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ATF3P18847 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ATF3P18847 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ATF3P18847 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ATF3P18847 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATF3P18847 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATF3P18847 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATF3P18847 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATF3P18847 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATF3P18847 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATF3P18847 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATF3P18847 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATF3P18847 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATF3P18847 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATF3P18847 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATF3P18847 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ATF3P18847 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ATF3P18847 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATF3P18847 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms