Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRAP18433 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPRAP18433 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRAP18433 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPRAP18433 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRAP18433 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPRAP18433 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRAP18433 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRAP18433 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRAP18433 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRAP18433 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRAP18433 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms