Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
GCFC2P16383 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GCFC2P16383 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GCFC2P16383 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GCFC2P16383 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GCFC2P16383 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GCFC2P16383 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GCFC2P16383 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GCFC2P16383 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GCFC2P16383 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GCFC2P16383 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GCFC2P16383 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCFC2P16383 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCFC2P16383 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GCFC2P16383 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GCFC2P16383 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GCFC2P16383 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GCFC2P16383 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GCFC2P16383 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GCFC2P16383 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GCFC2P16383 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GCFC2P16383 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GCFC2P16383 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GCFC2P16383 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GCFC2P16383 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GCFC2P16383 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GCFC2P16383 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GCFC2P16383 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GCFC2P16383 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GCFC2P16383 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GCFC2P16383 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GCFC2P16383 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GCFC2P16383 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GCFC2P16383 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GCFC2P16383 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GCFC2P16383 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GCFC2P16383 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
GCFC2P16383 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GCFC2P16383 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GCFC2P16383 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms