Protein–RNA interactions for Protein: P16150

SPN, Leukosialin, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNP16150 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPNP16150 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPNP16150 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPNP16150 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPNP16150 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPNP16150 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPNP16150 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPNP16150 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPNP16150 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPNP16150 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPNP16150 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPNP16150 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPNP16150 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPNP16150 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPNP16150 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPNP16150 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPNP16150 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPNP16150 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPNP16150 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPNP16150 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPNP16150 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPNP16150 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPNP16150 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPNP16150 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPNP16150 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPNP16150 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPNP16150 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPNP16150 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPNP16150 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPNP16150 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPNP16150 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPNP16150 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPNP16150 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPNP16150 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPNP16150 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPNP16150 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPNP16150 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPNP16150 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPNP16150 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPNP16150 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPNP16150 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPNP16150 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPNP16150 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPNP16150 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPNP16150 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPNP16150 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPNP16150 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPNP16150 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPNP16150 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPNP16150 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPNP16150 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPNP16150 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPNP16150 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPNP16150 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPNP16150 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPNP16150 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPNP16150 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPNP16150 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPNP16150 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPNP16150 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPNP16150 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPNP16150 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPNP16150 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPNP16150 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPNP16150 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPNP16150 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPNP16150 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPNP16150 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPNP16150 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPNP16150 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPNP16150 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPNP16150 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPNP16150 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPNP16150 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPNP16150 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPNP16150 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPNP16150 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNP16150 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNP16150 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNP16150 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNP16150 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNP16150 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNP16150 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPNP16150 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPNP16150 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPNP16150 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPNP16150 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNP16150 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNP16150 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNP16150 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNP16150 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNP16150 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNP16150 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPNP16150 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPNP16150 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPNP16150 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPNP16150 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPNP16150 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPNP16150 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPNP16150 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms