Protein–RNA interactions for Protein: P15863

PAX1, Paired box protein Pax-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX1P15863 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX1P15863 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX1P15863 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX1P15863 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX1P15863 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX1P15863 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX1P15863 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX1P15863 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX1P15863 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX1P15863 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX1P15863 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX1P15863 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX1P15863 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX1P15863 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX1P15863 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX1P15863 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX1P15863 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX1P15863 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAX1P15863 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAX1P15863 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAX1P15863 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAX1P15863 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAX1P15863 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAX1P15863 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAX1P15863 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAX1P15863 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAX1P15863 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAX1P15863 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAX1P15863 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAX1P15863 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAX1P15863 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAX1P15863 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX1P15863 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX1P15863 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAX1P15863 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PAX1P15863 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAX1P15863 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAX1P15863 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAX1P15863 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAX1P15863 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX1P15863 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAX1P15863 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAX1P15863 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PAX1P15863 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAX1P15863 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAX1P15863 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAX1P15863 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAX1P15863 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAX1P15863 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAX1P15863 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAX1P15863 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAX1P15863 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAX1P15863 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAX1P15863 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAX1P15863 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAX1P15863 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAX1P15863 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAX1P15863 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAX1P15863 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX1P15863 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX1P15863 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX1P15863 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX1P15863 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX1P15863 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX1P15863 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX1P15863 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX1P15863 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAX1P15863 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAX1P15863 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAX1P15863 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAX1P15863 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAX1P15863 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAX1P15863 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAX1P15863 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAX1P15863 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAX1P15863 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAX1P15863 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAX1P15863 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAX1P15863 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAX1P15863 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PAX1P15863 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAX1P15863 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAX1P15863 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAX1P15863 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAX1P15863 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX1P15863 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX1P15863 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX1P15863 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX1P15863 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX1P15863 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX1P15863 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAX1P15863 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PAX1P15863 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAX1P15863 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX1P15863 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX1P15863 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX1P15863 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX1P15863 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX1P15863 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAX1P15863 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms