Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCKDHAP12694 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCKDHAP12694 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCKDHAP12694 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCKDHAP12694 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCKDHAP12694 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCKDHAP12694 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCKDHAP12694 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCKDHAP12694 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCKDHAP12694 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCKDHAP12694 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCKDHAP12694 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCKDHAP12694 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCKDHAP12694 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCKDHAP12694 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCKDHAP12694 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCKDHAP12694 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCKDHAP12694 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BCKDHAP12694 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCKDHAP12694 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCKDHAP12694 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCKDHAP12694 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCKDHAP12694 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCKDHAP12694 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCKDHAP12694 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCKDHAP12694 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCKDHAP12694 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCKDHAP12694 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCKDHAP12694 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCKDHAP12694 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BCKDHAP12694 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCKDHAP12694 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCKDHAP12694 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCKDHAP12694 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCKDHAP12694 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCKDHAP12694 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCKDHAP12694 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCKDHAP12694 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDHAP12694 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDHAP12694 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCKDHAP12694 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCKDHAP12694 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCKDHAP12694 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCKDHAP12694 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCKDHAP12694 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCKDHAP12694 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCKDHAP12694 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCKDHAP12694 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCKDHAP12694 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCKDHAP12694 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BCKDHAP12694 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms