Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
LAMC1P11047 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
LAMC1P11047 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.45■■■■□ 3.75
LAMC1P11047 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
LAMC1P11047 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
LAMC1P11047 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
LAMC1P11047 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
LAMC1P11047 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
LAMC1P11047 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
LAMC1P11047 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
LAMC1P11047 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
LAMC1P11047 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
LAMC1P11047 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
LAMC1P11047 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
LAMC1P11047 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
LAMC1P11047 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
LAMC1P11047 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC1P11047 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMC1P11047 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
LAMC1P11047 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
LAMC1P11047 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
LAMC1P11047 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
LAMC1P11047 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LAMC1P11047 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LAMC1P11047 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LAMC1P11047 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
LAMC1P11047 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
LAMC1P11047 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
LAMC1P11047 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.18■■■■□ 3.7
LAMC1P11047 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LAMC1P11047 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
LAMC1P11047 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LAMC1P11047 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
LAMC1P11047 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
LAMC1P11047 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
LAMC1P11047 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
LAMC1P11047 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.13■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
LAMC1P11047 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
LAMC1P11047 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
LAMC1P11047 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
LAMC1P11047 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
LAMC1P11047 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
LAMC1P11047 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
LAMC1P11047 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
LAMC1P11047 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
LAMC1P11047 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
LAMC1P11047 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
LAMC1P11047 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
LAMC1P11047 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LAMC1P11047 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
LAMC1P11047 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
LAMC1P11047 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
LAMC1P11047 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LAMC1P11047 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LAMC1P11047 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
LAMC1P11047 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
LAMC1P11047 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC1P11047 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LAMC1P11047 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
LAMC1P11047 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LAMC1P11047 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LAMC1P11047 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LAMC1P11047 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC1P11047 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LAMC1P11047 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
LAMC1P11047 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LAMC1P11047 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
LAMC1P11047 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LAMC1P11047 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LAMC1P11047 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LAMC1P11047 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LAMC1P11047 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LAMC1P11047 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms