Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTSAP10619 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTSAP10619 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CTSAP10619 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTSAP10619 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTSAP10619 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTSAP10619 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTSAP10619 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTSAP10619 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTSAP10619 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTSAP10619 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTSAP10619 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTSAP10619 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTSAP10619 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTSAP10619 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTSAP10619 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTSAP10619 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTSAP10619 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTSAP10619 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTSAP10619 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTSAP10619 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTSAP10619 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTSAP10619 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTSAP10619 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTSAP10619 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTSAP10619 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTSAP10619 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTSAP10619 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTSAP10619 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CTSAP10619 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CTSAP10619 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTSAP10619 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTSAP10619 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTSAP10619 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTSAP10619 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTSAP10619 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTSAP10619 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTSAP10619 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSAP10619 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSAP10619 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSAP10619 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSAP10619 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTSAP10619 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTSAP10619 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTSAP10619 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTSAP10619 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CTSAP10619 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CTSAP10619 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTSAP10619 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTSAP10619 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTSAP10619 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CTSAP10619 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTSAP10619 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTSAP10619 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTSAP10619 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTSAP10619 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CTSAP10619 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTSAP10619 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSAP10619 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSAP10619 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSAP10619 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTSAP10619 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTSAP10619 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTSAP10619 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTSAP10619 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTSAP10619 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTSAP10619 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTSAP10619 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTSAP10619 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTSAP10619 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CTSAP10619 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTSAP10619 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTSAP10619 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTSAP10619 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTSAP10619 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTSAP10619 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CTSAP10619 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTSAP10619 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTSAP10619 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTSAP10619 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTSAP10619 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTSAP10619 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTSAP10619 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTSAP10619 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTSAP10619 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTSAP10619 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTSAP10619 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTSAP10619 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTSAP10619 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTSAP10619 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTSAP10619 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTSAP10619 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTSAP10619 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTSAP10619 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTSAP10619 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTSAP10619 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTSAP10619 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTSAP10619 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTSAP10619 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTSAP10619 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms