Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2F1P10589 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F1P10589 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F1P10589 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F1P10589 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR2F1P10589 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2F1P10589 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NR2F1P10589 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2F1P10589 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR2F1P10589 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR2F1P10589 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR2F1P10589 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NR2F1P10589 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2F1P10589 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2F1P10589 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2F1P10589 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2F1P10589 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2F1P10589 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2F1P10589 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2F1P10589 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2F1P10589 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2F1P10589 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2F1P10589 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2F1P10589 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2F1P10589 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2F1P10589 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR2F1P10589 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2F1P10589 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2F1P10589 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2F1P10589 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR2F1P10589 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR2F1P10589 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms