Protein–RNA interactions for Protein: P10092

CALCB, Calcitonin gene-related peptide 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCBP10092 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALCBP10092 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALCBP10092 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALCBP10092 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALCBP10092 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCBP10092 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALCBP10092 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALCBP10092 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALCBP10092 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALCBP10092 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALCBP10092 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALCBP10092 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALCBP10092 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALCBP10092 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALCBP10092 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCBP10092 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALCBP10092 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CALCBP10092 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCBP10092 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCBP10092 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCBP10092 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CALCBP10092 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CALCBP10092 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCBP10092 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCBP10092 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCBP10092 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CALCBP10092 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCBP10092 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCBP10092 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCBP10092 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CALCBP10092 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CALCBP10092 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCBP10092 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCBP10092 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALCBP10092 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCBP10092 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALCBP10092 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALCBP10092 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCBP10092 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALCBP10092 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCBP10092 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCBP10092 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALCBP10092 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCBP10092 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCBP10092 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCBP10092 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCBP10092 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALCBP10092 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCBP10092 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCBP10092 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCBP10092 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCBP10092 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCBP10092 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCBP10092 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCBP10092 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCBP10092 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCBP10092 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCBP10092 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCBP10092 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCBP10092 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCBP10092 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCBP10092 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCBP10092 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCBP10092 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCBP10092 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCBP10092 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCBP10092 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCBP10092 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCBP10092 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCBP10092 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCBP10092 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCBP10092 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCBP10092 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCBP10092 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCBP10092 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCBP10092 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCBP10092 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCBP10092 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCBP10092 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCBP10092 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCBP10092 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCBP10092 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCBP10092 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCBP10092 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCBP10092 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCBP10092 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCBP10092 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCBP10092 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCBP10092 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCBP10092 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCBP10092 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCBP10092 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCBP10092 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCBP10092 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCBP10092 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCBP10092 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCBP10092 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCBP10092 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCBP10092 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCBP10092 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms