Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC2BP0DI82 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC2BP0DI82 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC2BP0DI82 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC2BP0DI82 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC2BP0DI82 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC2BP0DI82 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC2BP0DI82 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC2BP0DI82 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC2BP0DI82 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC2BP0DI82 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC2BP0DI82 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC2BP0DI82 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC2BP0DI82 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC2BP0DI82 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC2BP0DI82 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC2BP0DI82 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC2BP0DI82 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.7 ms