Protein–RNA interactions for Protein: P0CG32

ZCCHC18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC18P0CG32 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC18P0CG32 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC18P0CG32 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC18P0CG32 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC18P0CG32 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC18P0CG32 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC18P0CG32 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC18P0CG32 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC18P0CG32 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC18P0CG32 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC18P0CG32 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZCCHC18P0CG32 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC18P0CG32 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC18P0CG32 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC18P0CG32 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC18P0CG32 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC18P0CG32 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC18P0CG32 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC18P0CG32 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC18P0CG32 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC18P0CG32 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC18P0CG32 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC18P0CG32 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZCCHC18P0CG32 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZCCHC18P0CG32 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC18P0CG32 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC18P0CG32 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC18P0CG32 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC18P0CG32 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms