Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRR29P0C7W0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRR29P0C7W0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRR29P0C7W0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRR29P0C7W0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRR29P0C7W0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRR29P0C7W0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRR29P0C7W0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRR29P0C7W0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRR29P0C7W0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRR29P0C7W0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRR29P0C7W0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRR29P0C7W0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRR29P0C7W0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms