Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M7

ACSM4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM4P0C7M7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACSM4P0C7M7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSM4P0C7M7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSM4P0C7M7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM4P0C7M7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSM4P0C7M7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSM4P0C7M7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms