Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRCP08575 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRCP08575 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRCP08575 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRCP08575 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRCP08575 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRCP08575 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRCP08575 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRCP08575 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PTPRCP08575 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRCP08575 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRCP08575 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRCP08575 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PTPRCP08575 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRCP08575 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRCP08575 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRCP08575 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRCP08575 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTPRCP08575 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRCP08575 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRCP08575 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PTPRCP08575 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRCP08575 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRCP08575 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRCP08575 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRCP08575 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRCP08575 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRCP08575 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRCP08575 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRCP08575 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRCP08575 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRCP08575 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRCP08575 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRCP08575 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRCP08575 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRCP08575 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRCP08575 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRCP08575 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRCP08575 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRCP08575 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRCP08575 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRCP08575 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRCP08575 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRCP08575 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRCP08575 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRCP08575 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRCP08575 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRCP08575 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRCP08575 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRCP08575 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRCP08575 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRCP08575 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRCP08575 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRCP08575 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRCP08575 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRCP08575 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRCP08575 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms