Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLBP06746 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLBP06746 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLBP06746 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
POLBP06746 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLBP06746 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLBP06746 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLBP06746 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLBP06746 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLBP06746 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
POLBP06746 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLBP06746 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLBP06746 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLBP06746 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLBP06746 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLBP06746 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLBP06746 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLBP06746 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLBP06746 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLBP06746 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLBP06746 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLBP06746 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLBP06746 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLBP06746 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLBP06746 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLBP06746 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLBP06746 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLBP06746 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLBP06746 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLBP06746 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLBP06746 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLBP06746 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLBP06746 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLBP06746 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLBP06746 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLBP06746 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLBP06746 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLBP06746 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLBP06746 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLBP06746 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLBP06746 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLBP06746 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLBP06746 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLBP06746 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
POLBP06746 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLBP06746 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLBP06746 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLBP06746 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLBP06746 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLBP06746 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLBP06746 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLBP06746 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLBP06746 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLBP06746 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLBP06746 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLBP06746 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLBP06746 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLBP06746 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLBP06746 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLBP06746 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLBP06746 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLBP06746 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLBP06746 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLBP06746 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POLBP06746 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLBP06746 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLBP06746 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLBP06746 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLBP06746 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLBP06746 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLBP06746 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLBP06746 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLBP06746 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLBP06746 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLBP06746 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLBP06746 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLBP06746 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLBP06746 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLBP06746 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLBP06746 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLBP06746 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POLBP06746 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLBP06746 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLBP06746 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLBP06746 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLBP06746 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLBP06746 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLBP06746 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLBP06746 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLBP06746 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLBP06746 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POLBP06746 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLBP06746 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLBP06746 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLBP06746 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLBP06746 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLBP06746 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLBP06746 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLBP06746 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLBP06746 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms