Protein–RNA interactions for Protein: P05787

KRT8, Keratin, type II cytoskeletal 8, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8P05787 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT8P05787 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT8P05787 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT8P05787 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT8P05787 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT8P05787 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT8P05787 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT8P05787 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT8P05787 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT8P05787 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT8P05787 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT8P05787 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT8P05787 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT8P05787 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT8P05787 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT8P05787 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT8P05787 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT8P05787 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT8P05787 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT8P05787 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT8P05787 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT8P05787 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT8P05787 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT8P05787 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT8P05787 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT8P05787 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT8P05787 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT8P05787 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT8P05787 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT8P05787 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT8P05787 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT8P05787 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT8P05787 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT8P05787 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT8P05787 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT8P05787 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT8P05787 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT8P05787 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT8P05787 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT8P05787 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT8P05787 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT8P05787 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT8P05787 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT8P05787 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT8P05787 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT8P05787 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT8P05787 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT8P05787 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT8P05787 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT8P05787 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT8P05787 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT8P05787 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT8P05787 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT8P05787 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT8P05787 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT8P05787 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT8P05787 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT8P05787 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT8P05787 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT8P05787 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT8P05787 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT8P05787 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT8P05787 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT8P05787 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT8P05787 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT8P05787 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT8P05787 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT8P05787 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT8P05787 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT8P05787 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT8P05787 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT8P05787 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT8P05787 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT8P05787 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT8P05787 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT8P05787 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT8P05787 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT8P05787 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT8P05787 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT8P05787 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT8P05787 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT8P05787 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT8P05787 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT8P05787 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT8P05787 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT8P05787 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT8P05787 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT8P05787 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT8P05787 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT8P05787 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT8P05787 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT8P05787 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT8P05787 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT8P05787 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT8P05787 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT8P05787 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT8P05787 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT8P05787 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT8P05787 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT8P05787 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms