Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFAP2AP05549 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAP2AP05549 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAP2AP05549 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAP2AP05549 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFAP2AP05549 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFAP2AP05549 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFAP2AP05549 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFAP2AP05549 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFAP2AP05549 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFAP2AP05549 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFAP2AP05549 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAP2AP05549 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAP2AP05549 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAP2AP05549 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFAP2AP05549 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFAP2AP05549 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFAP2AP05549 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFAP2AP05549 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFAP2AP05549 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFAP2AP05549 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFAP2AP05549 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAP2AP05549 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAP2AP05549 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAP2AP05549 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFAP2AP05549 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFAP2AP05549 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFAP2AP05549 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFAP2AP05549 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFAP2AP05549 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFAP2AP05549 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFAP2AP05549 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFAP2AP05549 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAP2AP05549 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAP2AP05549 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAP2AP05549 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TFAP2AP05549 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFAP2AP05549 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFAP2AP05549 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAP2AP05549 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFAP2AP05549 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAP2AP05549 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAP2AP05549 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFAP2AP05549 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFAP2AP05549 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFAP2AP05549 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFAP2AP05549 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFAP2AP05549 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFAP2AP05549 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFAP2AP05549 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFAP2AP05549 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms