Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EDN1P05305 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDN1P05305 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDN1P05305 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDN1P05305 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDN1P05305 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDN1P05305 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDN1P05305 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDN1P05305 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDN1P05305 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDN1P05305 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDN1P05305 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDN1P05305 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDN1P05305 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EDN1P05305 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDN1P05305 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDN1P05305 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EDN1P05305 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EDN1P05305 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDN1P05305 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDN1P05305 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDN1P05305 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDN1P05305 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDN1P05305 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDN1P05305 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDN1P05305 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDN1P05305 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDN1P05305 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDN1P05305 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDN1P05305 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDN1P05305 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDN1P05305 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDN1P05305 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDN1P05305 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDN1P05305 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDN1P05305 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDN1P05305 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDN1P05305 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDN1P05305 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDN1P05305 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDN1P05305 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDN1P05305 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDN1P05305 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EDN1P05305 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EDN1P05305 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
EDN1P05305 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EDN1P05305 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDN1P05305 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDN1P05305 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDN1P05305 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDN1P05305 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EDN1P05305 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EDN1P05305 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EDN1P05305 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDN1P05305 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDN1P05305 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDN1P05305 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDN1P05305 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDN1P05305 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EDN1P05305 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EDN1P05305 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EDN1P05305 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EDN1P05305 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EDN1P05305 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDN1P05305 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDN1P05305 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EDN1P05305 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EDN1P05305 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EDN1P05305 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EDN1P05305 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EDN1P05305 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
EDN1P05305 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EDN1P05305 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDN1P05305 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDN1P05305 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDN1P05305 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDN1P05305 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDN1P05305 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDN1P05305 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EDN1P05305 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDN1P05305 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDN1P05305 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EDN1P05305 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDN1P05305 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EDN1P05305 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EDN1P05305 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDN1P05305 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDN1P05305 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDN1P05305 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDN1P05305 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EDN1P05305 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDN1P05305 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDN1P05305 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDN1P05305 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EDN1P05305 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EDN1P05305 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EDN1P05305 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EDN1P05305 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDN1P05305 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EDN1P05305 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms