Protein–RNA interactions for Protein: P04921

GYPC, Glycophorin-C, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPCP04921 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GYPCP04921 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GYPCP04921 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GYPCP04921 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GYPCP04921 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GYPCP04921 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GYPCP04921 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GYPCP04921 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GYPCP04921 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GYPCP04921 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GYPCP04921 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GYPCP04921 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GYPCP04921 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GYPCP04921 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GYPCP04921 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GYPCP04921 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GYPCP04921 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GYPCP04921 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GYPCP04921 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GYPCP04921 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GYPCP04921 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GYPCP04921 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GYPCP04921 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GYPCP04921 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GYPCP04921 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GYPCP04921 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GYPCP04921 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GYPCP04921 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GYPCP04921 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GYPCP04921 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GYPCP04921 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GYPCP04921 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GYPCP04921 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GYPCP04921 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GYPCP04921 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GYPCP04921 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GYPCP04921 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GYPCP04921 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GYPCP04921 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GYPCP04921 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GYPCP04921 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GYPCP04921 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GYPCP04921 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GYPCP04921 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GYPCP04921 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GYPCP04921 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GYPCP04921 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GYPCP04921 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GYPCP04921 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GYPCP04921 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GYPCP04921 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GYPCP04921 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GYPCP04921 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GYPCP04921 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GYPCP04921 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GYPCP04921 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GYPCP04921 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GYPCP04921 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GYPCP04921 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GYPCP04921 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GYPCP04921 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GYPCP04921 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GYPCP04921 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GYPCP04921 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GYPCP04921 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GYPCP04921 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GYPCP04921 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GYPCP04921 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GYPCP04921 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GYPCP04921 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GYPCP04921 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GYPCP04921 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GYPCP04921 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GYPCP04921 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GYPCP04921 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GYPCP04921 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GYPCP04921 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GYPCP04921 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GYPCP04921 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GYPCP04921 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GYPCP04921 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GYPCP04921 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
GYPCP04921 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GYPCP04921 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GYPCP04921 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
GYPCP04921 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GYPCP04921 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GYPCP04921 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GYPCP04921 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GYPCP04921 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GYPCP04921 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GYPCP04921 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GYPCP04921 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GYPCP04921 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GYPCP04921 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GYPCP04921 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GYPCP04921 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GYPCP04921 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GYPCP04921 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GYPCP04921 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms