Protein–RNA interactions for Protein: P04180

LCAT, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCATP04180 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCATP04180 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCATP04180 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCATP04180 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCATP04180 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCATP04180 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCATP04180 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCATP04180 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCATP04180 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LCATP04180 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCATP04180 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LCATP04180 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCATP04180 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCATP04180 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCATP04180 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCATP04180 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCATP04180 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCATP04180 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCATP04180 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCATP04180 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCATP04180 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCATP04180 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LCATP04180 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCATP04180 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCATP04180 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCATP04180 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCATP04180 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCATP04180 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCATP04180 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCATP04180 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCATP04180 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LCATP04180 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LCATP04180 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCATP04180 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LCATP04180 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCATP04180 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCATP04180 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCATP04180 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCATP04180 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCATP04180 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCATP04180 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCATP04180 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCATP04180 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCATP04180 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCATP04180 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCATP04180 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCATP04180 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCATP04180 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCATP04180 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCATP04180 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCATP04180 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCATP04180 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCATP04180 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCATP04180 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCATP04180 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCATP04180 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCATP04180 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCATP04180 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCATP04180 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCATP04180 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCATP04180 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCATP04180 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCATP04180 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCATP04180 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCATP04180 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCATP04180 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCATP04180 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCATP04180 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCATP04180 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCATP04180 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCATP04180 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCATP04180 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCATP04180 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCATP04180 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCATP04180 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCATP04180 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCATP04180 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCATP04180 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCATP04180 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCATP04180 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCATP04180 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCATP04180 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCATP04180 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCATP04180 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LCATP04180 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCATP04180 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCATP04180 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCATP04180 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCATP04180 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCATP04180 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCATP04180 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCATP04180 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCATP04180 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCATP04180 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCATP04180 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCATP04180 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCATP04180 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCATP04180 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCATP04180 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCATP04180 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms