Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VIPP01282 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VIPP01282 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VIPP01282 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIPP01282 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIPP01282 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIPP01282 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIPP01282 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIPP01282 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIPP01282 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIPP01282 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIPP01282 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIPP01282 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIPP01282 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIPP01282 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIPP01282 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIPP01282 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIPP01282 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIPP01282 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VIPP01282 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VIPP01282 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VIPP01282 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIPP01282 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIPP01282 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIPP01282 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIPP01282 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIPP01282 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIPP01282 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIPP01282 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIPP01282 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIPP01282 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIPP01282 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VIPP01282 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VIPP01282 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VIPP01282 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VIPP01282 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIPP01282 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIPP01282 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIPP01282 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIPP01282 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIPP01282 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIPP01282 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VIPP01282 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VIPP01282 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VIPP01282 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VIPP01282 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VIPP01282 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VIPP01282 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VIPP01282 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VIPP01282 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VIPP01282 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIPP01282 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIPP01282 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIPP01282 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VIPP01282 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VIPP01282 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VIPP01282 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VIPP01282 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIPP01282 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VIPP01282 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VIPP01282 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VIPP01282 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VIPP01282 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VIPP01282 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIPP01282 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIPP01282 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIPP01282 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VIPP01282 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIPP01282 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIPP01282 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIPP01282 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VIPP01282 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIPP01282 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIPP01282 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIPP01282 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIPP01282 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIPP01282 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VIPP01282 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIPP01282 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIPP01282 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIPP01282 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VIPP01282 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VIPP01282 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIPP01282 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIPP01282 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIPP01282 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIPP01282 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIPP01282 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIPP01282 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIPP01282 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIPP01282 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIPP01282 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIPP01282 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIPP01282 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIPP01282 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIPP01282 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIPP01282 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VIPP01282 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VIPP01282 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VIPP01282 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms