Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTCP00480 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTCP00480 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTCP00480 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
OTCP00480 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTCP00480 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTCP00480 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTCP00480 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTCP00480 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTCP00480 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTCP00480 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTCP00480 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTCP00480 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTCP00480 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTCP00480 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTCP00480 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTCP00480 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTCP00480 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTCP00480 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTCP00480 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTCP00480 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTCP00480 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTCP00480 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTCP00480 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTCP00480 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
OTCP00480 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTCP00480 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTCP00480 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTCP00480 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTCP00480 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTCP00480 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTCP00480 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTCP00480 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTCP00480 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTCP00480 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTCP00480 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTCP00480 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTCP00480 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTCP00480 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTCP00480 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
OTCP00480 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTCP00480 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
OTCP00480 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTCP00480 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTCP00480 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTCP00480 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTCP00480 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTCP00480 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTCP00480 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTCP00480 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTCP00480 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTCP00480 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTCP00480 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTCP00480 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTCP00480 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTCP00480 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTCP00480 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTCP00480 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTCP00480 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTCP00480 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTCP00480 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTCP00480 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTCP00480 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
OTCP00480 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTCP00480 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTCP00480 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTCP00480 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTCP00480 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTCP00480 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTCP00480 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTCP00480 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTCP00480 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTCP00480 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTCP00480 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTCP00480 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTCP00480 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTCP00480 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTCP00480 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTCP00480 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTCP00480 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTCP00480 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTCP00480 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTCP00480 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTCP00480 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTCP00480 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTCP00480 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTCP00480 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTCP00480 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTCP00480 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTCP00480 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTCP00480 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTCP00480 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTCP00480 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTCP00480 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
OTCP00480 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTCP00480 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTCP00480 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTCP00480 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTCP00480 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTCP00480 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms