Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TOP3BO95985 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOP3BO95985 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP3BO95985 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP3BO95985 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP3BO95985 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP3BO95985 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP3BO95985 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP3BO95985 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP3BO95985 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP3BO95985 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP3BO95985 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP3BO95985 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOP3BO95985 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
TOP3BO95985 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TOP3BO95985 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOP3BO95985 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOP3BO95985 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOP3BO95985 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOP3BO95985 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOP3BO95985 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOP3BO95985 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOP3BO95985 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOP3BO95985 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOP3BO95985 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms