Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP29O95721 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNAP29O95721 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP29O95721 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP29O95721 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNAP29O95721 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms