Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB6O95452 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB6O95452 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB6O95452 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB6O95452 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJB6O95452 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB6O95452 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJB6O95452 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJB6O95452 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GJB6O95452 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJB6O95452 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJB6O95452 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJB6O95452 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJB6O95452 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJB6O95452 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJB6O95452 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJB6O95452 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJB6O95452 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB6O95452 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB6O95452 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB6O95452 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB6O95452 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB6O95452 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB6O95452 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJB6O95452 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJB6O95452 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJB6O95452 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB6O95452 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB6O95452 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB6O95452 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB6O95452 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB6O95452 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB6O95452 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB6O95452 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB6O95452 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB6O95452 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB6O95452 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB6O95452 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB6O95452 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB6O95452 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB6O95452 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GJB6O95452 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJB6O95452 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJB6O95452 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJB6O95452 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB6O95452 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB6O95452 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJB6O95452 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJB6O95452 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB6O95452 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB6O95452 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB6O95452 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB6O95452 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJB6O95452 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJB6O95452 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJB6O95452 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJB6O95452 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJB6O95452 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJB6O95452 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJB6O95452 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB6O95452 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB6O95452 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB6O95452 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB6O95452 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB6O95452 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB6O95452 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJB6O95452 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJB6O95452 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJB6O95452 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB6O95452 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB6O95452 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB6O95452 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB6O95452 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB6O95452 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB6O95452 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GJB6O95452 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJB6O95452 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJB6O95452 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJB6O95452 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJB6O95452 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJB6O95452 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB6O95452 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB6O95452 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB6O95452 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB6O95452 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB6O95452 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB6O95452 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB6O95452 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB6O95452 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB6O95452 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB6O95452 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB6O95452 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB6O95452 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJB6O95452 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJB6O95452 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB6O95452 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJB6O95452 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJB6O95452 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB6O95452 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB6O95452 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms