Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNUPNO95149 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNUPNO95149 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNUPNO95149 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNUPNO95149 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNUPNO95149 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SNUPNO95149 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNUPNO95149 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNUPNO95149 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNUPNO95149 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNUPNO95149 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNUPNO95149 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNUPNO95149 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNUPNO95149 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNUPNO95149 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNUPNO95149 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNUPNO95149 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNUPNO95149 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNUPNO95149 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNUPNO95149 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNUPNO95149 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNUPNO95149 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNUPNO95149 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNUPNO95149 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNUPNO95149 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNUPNO95149 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNUPNO95149 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNUPNO95149 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNUPNO95149 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNUPNO95149 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNUPNO95149 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNUPNO95149 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNUPNO95149 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SNUPNO95149 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNUPNO95149 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNUPNO95149 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNUPNO95149 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNUPNO95149 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNUPNO95149 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms