Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATBO75879 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATBO75879 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATBO75879 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATBO75879 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATBO75879 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATBO75879 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATBO75879 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATBO75879 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATBO75879 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATBO75879 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATBO75879 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATBO75879 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATBO75879 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATBO75879 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATBO75879 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATBO75879 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GATBO75879 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GATBO75879 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATBO75879 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATBO75879 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATBO75879 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATBO75879 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATBO75879 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATBO75879 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATBO75879 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATBO75879 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATBO75879 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATBO75879 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATBO75879 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATBO75879 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATBO75879 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATBO75879 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATBO75879 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATBO75879 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATBO75879 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATBO75879 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATBO75879 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATBO75879 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATBO75879 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATBO75879 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATBO75879 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATBO75879 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATBO75879 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GATBO75879 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATBO75879 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATBO75879 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATBO75879 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATBO75879 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GATBO75879 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATBO75879 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATBO75879 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATBO75879 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATBO75879 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATBO75879 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATBO75879 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATBO75879 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATBO75879 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATBO75879 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATBO75879 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATBO75879 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATBO75879 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATBO75879 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATBO75879 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATBO75879 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATBO75879 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATBO75879 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATBO75879 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATBO75879 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATBO75879 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATBO75879 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATBO75879 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATBO75879 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATBO75879 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATBO75879 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATBO75879 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATBO75879 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATBO75879 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATBO75879 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATBO75879 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATBO75879 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATBO75879 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATBO75879 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATBO75879 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATBO75879 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATBO75879 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATBO75879 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATBO75879 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATBO75879 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATBO75879 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATBO75879 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATBO75879 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATBO75879 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATBO75879 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATBO75879 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATBO75879 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATBO75879 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATBO75879 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATBO75879 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATBO75879 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms