Protein–RNA interactions for Protein: O75677

RFPL1, Ret finger protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL1O75677 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RFPL1O75677 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFPL1O75677 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFPL1O75677 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RFPL1O75677 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFPL1O75677 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFPL1O75677 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFPL1O75677 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFPL1O75677 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFPL1O75677 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFPL1O75677 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFPL1O75677 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFPL1O75677 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RFPL1O75677 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFPL1O75677 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFPL1O75677 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFPL1O75677 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFPL1O75677 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFPL1O75677 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFPL1O75677 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFPL1O75677 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFPL1O75677 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFPL1O75677 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFPL1O75677 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFPL1O75677 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFPL1O75677 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFPL1O75677 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFPL1O75677 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFPL1O75677 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RFPL1O75677 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFPL1O75677 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFPL1O75677 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFPL1O75677 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFPL1O75677 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RFPL1O75677 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RFPL1O75677 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RFPL1O75677 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFPL1O75677 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms