Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCATO75600 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCATO75600 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCATO75600 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCATO75600 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCATO75600 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCATO75600 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCATO75600 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCATO75600 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCATO75600 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCATO75600 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GCATO75600 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GCATO75600 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCATO75600 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCATO75600 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCATO75600 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCATO75600 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCATO75600 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GCATO75600 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCATO75600 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GCATO75600 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCATO75600 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCATO75600 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCATO75600 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCATO75600 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCATO75600 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCATO75600 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCATO75600 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCATO75600 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCATO75600 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCATO75600 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCATO75600 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCATO75600 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GCATO75600 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCATO75600 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCATO75600 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCATO75600 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCATO75600 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GCATO75600 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GCATO75600 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCATO75600 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GCATO75600 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCATO75600 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCATO75600 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCATO75600 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCATO75600 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCATO75600 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCATO75600 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCATO75600 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCATO75600 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCATO75600 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCATO75600 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCATO75600 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCATO75600 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCATO75600 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCATO75600 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCATO75600 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCATO75600 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCATO75600 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCATO75600 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCATO75600 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCATO75600 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCATO75600 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCATO75600 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCATO75600 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCATO75600 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCATO75600 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCATO75600 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCATO75600 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCATO75600 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCATO75600 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCATO75600 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCATO75600 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCATO75600 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCATO75600 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCATO75600 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCATO75600 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCATO75600 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCATO75600 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCATO75600 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCATO75600 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCATO75600 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCATO75600 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCATO75600 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCATO75600 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCATO75600 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCATO75600 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCATO75600 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCATO75600 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCATO75600 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCATO75600 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GCATO75600 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCATO75600 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCATO75600 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCATO75600 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCATO75600 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCATO75600 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCATO75600 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCATO75600 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GCATO75600 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms