Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LGR5O75473 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
LGR5O75473 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
LGR5O75473 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
LGR5O75473 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LGR5O75473 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LGR5O75473 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LGR5O75473 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LGR5O75473 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LGR5O75473 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LGR5O75473 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LGR5O75473 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LGR5O75473 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LGR5O75473 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LGR5O75473 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LGR5O75473 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LGR5O75473 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LGR5O75473 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LGR5O75473 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LGR5O75473 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LGR5O75473 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LGR5O75473 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LGR5O75473 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LGR5O75473 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LGR5O75473 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LGR5O75473 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LGR5O75473 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LGR5O75473 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LGR5O75473 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LGR5O75473 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LGR5O75473 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LGR5O75473 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LGR5O75473 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LGR5O75473 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LGR5O75473 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LGR5O75473 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LGR5O75473 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LGR5O75473 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LGR5O75473 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LGR5O75473 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LGR5O75473 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LGR5O75473 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LGR5O75473 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LGR5O75473 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LGR5O75473 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LGR5O75473 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LGR5O75473 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LGR5O75473 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LGR5O75473 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LGR5O75473 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LGR5O75473 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LGR5O75473 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LGR5O75473 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LGR5O75473 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LGR5O75473 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LGR5O75473 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LGR5O75473 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LGR5O75473 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LGR5O75473 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LGR5O75473 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LGR5O75473 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LGR5O75473 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LGR5O75473 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LGR5O75473 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LGR5O75473 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LGR5O75473 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LGR5O75473 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LGR5O75473 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LGR5O75473 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LGR5O75473 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LGR5O75473 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LGR5O75473 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LGR5O75473 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LGR5O75473 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LGR5O75473 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LGR5O75473 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LGR5O75473 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LGR5O75473 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LGR5O75473 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LGR5O75473 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LGR5O75473 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LGR5O75473 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LGR5O75473 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LGR5O75473 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LGR5O75473 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LGR5O75473 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LGR5O75473 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LGR5O75473 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LGR5O75473 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LGR5O75473 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LGR5O75473 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LGR5O75473 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LGR5O75473 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LGR5O75473 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LGR5O75473 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LGR5O75473 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LGR5O75473 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LGR5O75473 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LGR5O75473 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LGR5O75473 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms