Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
LRP5O75197 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRP5O75197 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRP5O75197 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRP5O75197 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LRP5O75197 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
LRP5O75197 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LRP5O75197 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LRP5O75197 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LRP5O75197 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LRP5O75197 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
LRP5O75197 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRP5O75197 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
LRP5O75197 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LRP5O75197 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LRP5O75197 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LRP5O75197 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LRP5O75197 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
LRP5O75197 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
LRP5O75197 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
LRP5O75197 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRP5O75197 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRP5O75197 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRP5O75197 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRP5O75197 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
LRP5O75197 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRP5O75197 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
LRP5O75197 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRP5O75197 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
LRP5O75197 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRP5O75197 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRP5O75197 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
LRP5O75197 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRP5O75197 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRP5O75197 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRP5O75197 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRP5O75197 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LRP5O75197 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRP5O75197 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LRP5O75197 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LRP5O75197 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRP5O75197 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
LRP5O75197 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRP5O75197 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LRP5O75197 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRP5O75197 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRP5O75197 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LRP5O75197 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
LRP5O75197 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRP5O75197 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LRP5O75197 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRP5O75197 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LRP5O75197 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRP5O75197 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRP5O75197 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRP5O75197 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRP5O75197 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRP5O75197 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRP5O75197 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRP5O75197 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRP5O75197 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRP5O75197 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LRP5O75197 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRP5O75197 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LRP5O75197 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRP5O75197 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LRP5O75197 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRP5O75197 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LRP5O75197 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRP5O75197 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LRP5O75197 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LRP5O75197 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LRP5O75197 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
LRP5O75197 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LRP5O75197 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRP5O75197 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRP5O75197 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
LRP5O75197 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LRP5O75197 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
LRP5O75197 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRP5O75197 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LRP5O75197 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRP5O75197 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LRP5O75197 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
LRP5O75197 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
LRP5O75197 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LRP5O75197 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
LRP5O75197 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
LRP5O75197 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
LRP5O75197 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LRP5O75197 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
LRP5O75197 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
LRP5O75197 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRP5O75197 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRP5O75197 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
LRP5O75197 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRP5O75197 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LRP5O75197 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LRP5O75197 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LRP5O75197 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms