Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC22O60826 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC22O60826 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC22O60826 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC22O60826 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC22O60826 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC22O60826 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC22O60826 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC22O60826 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC22O60826 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC22O60826 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC22O60826 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC22O60826 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC22O60826 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC22O60826 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC22O60826 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC22O60826 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC22O60826 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC22O60826 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC22O60826 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC22O60826 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC22O60826 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC22O60826 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC22O60826 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC22O60826 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC22O60826 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC22O60826 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC22O60826 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC22O60826 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC22O60826 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC22O60826 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC22O60826 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC22O60826 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC22O60826 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC22O60826 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC22O60826 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC22O60826 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC22O60826 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC22O60826 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC22O60826 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC22O60826 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms