Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNG3O60359 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNG3O60359 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNG3O60359 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNG3O60359 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNG3O60359 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNG3O60359 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNG3O60359 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNG3O60359 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNG3O60359 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNG3O60359 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CACNG3O60359 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNG3O60359 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNG3O60359 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNG3O60359 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNG3O60359 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNG3O60359 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNG3O60359 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNG3O60359 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNG3O60359 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNG3O60359 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNG3O60359 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNG3O60359 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNG3O60359 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNG3O60359 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNG3O60359 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNG3O60359 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNG3O60359 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNG3O60359 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNG3O60359 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNG3O60359 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNG3O60359 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNG3O60359 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNG3O60359 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNG3O60359 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNG3O60359 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNG3O60359 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNG3O60359 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACNG3O60359 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACNG3O60359 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNG3O60359 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNG3O60359 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNG3O60359 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CACNG3O60359 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNG3O60359 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNG3O60359 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNG3O60359 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms