Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAK2O60296 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAK2O60296 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
TRAK2O60296 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRAK2O60296 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TRAK2O60296 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TRAK2O60296 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TRAK2O60296 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAK2O60296 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAK2O60296 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAK2O60296 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAK2O60296 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAK2O60296 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAK2O60296 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAK2O60296 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAK2O60296 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAK2O60296 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAK2O60296 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAK2O60296 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAK2O60296 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAK2O60296 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAK2O60296 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAK2O60296 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAK2O60296 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAK2O60296 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAK2O60296 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAK2O60296 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAK2O60296 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAK2O60296 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAK2O60296 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAK2O60296 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAK2O60296 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAK2O60296 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAK2O60296 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAK2O60296 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAK2O60296 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAK2O60296 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAK2O60296 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAK2O60296 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAK2O60296 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAK2O60296 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAK2O60296 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAK2O60296 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAK2O60296 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAK2O60296 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAK2O60296 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAK2O60296 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAK2O60296 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAK2O60296 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRAK2O60296 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAK2O60296 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRAK2O60296 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRAK2O60296 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRAK2O60296 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms