Protein–RNA interactions for Protein: O60291

MGRN1, E3 ubiquitin-protein ligase MGRN1, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGRN1O60291 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MGRN1O60291 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MGRN1O60291 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MGRN1O60291 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MGRN1O60291 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MGRN1O60291 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MGRN1O60291 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MGRN1O60291 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MGRN1O60291 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MGRN1O60291 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MGRN1O60291 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MGRN1O60291 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MGRN1O60291 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MGRN1O60291 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MGRN1O60291 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MGRN1O60291 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MGRN1O60291 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MGRN1O60291 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MGRN1O60291 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MGRN1O60291 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MGRN1O60291 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MGRN1O60291 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MGRN1O60291 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MGRN1O60291 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MGRN1O60291 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MGRN1O60291 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MGRN1O60291 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MGRN1O60291 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MGRN1O60291 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MGRN1O60291 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MGRN1O60291 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MGRN1O60291 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MGRN1O60291 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MGRN1O60291 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MGRN1O60291 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MGRN1O60291 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MGRN1O60291 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MGRN1O60291 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MGRN1O60291 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MGRN1O60291 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MGRN1O60291 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MGRN1O60291 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MGRN1O60291 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MGRN1O60291 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MGRN1O60291 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MGRN1O60291 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MGRN1O60291 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MGRN1O60291 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MGRN1O60291 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MGRN1O60291 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MGRN1O60291 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MGRN1O60291 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MGRN1O60291 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms