Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PLIN1O60240 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PLIN1O60240 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PLIN1O60240 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PLIN1O60240 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PLIN1O60240 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PLIN1O60240 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PLIN1O60240 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PLIN1O60240 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PLIN1O60240 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PLIN1O60240 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PLIN1O60240 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
PLIN1O60240 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PLIN1O60240 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PLIN1O60240 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PLIN1O60240 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PLIN1O60240 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PLIN1O60240 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PLIN1O60240 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PLIN1O60240 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PLIN1O60240 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PLIN1O60240 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PLIN1O60240 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PLIN1O60240 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PLIN1O60240 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PLIN1O60240 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PLIN1O60240 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PLIN1O60240 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PLIN1O60240 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PLIN1O60240 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PLIN1O60240 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PLIN1O60240 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PLIN1O60240 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PLIN1O60240 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PLIN1O60240 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PLIN1O60240 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PLIN1O60240 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PLIN1O60240 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PLIN1O60240 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PLIN1O60240 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PLIN1O60240 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLIN1O60240 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLIN1O60240 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PLIN1O60240 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PLIN1O60240 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PLIN1O60240 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PLIN1O60240 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PLIN1O60240 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PLIN1O60240 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PLIN1O60240 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PLIN1O60240 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PLIN1O60240 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms