Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSNA1O43805 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SSNA1O43805 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSNA1O43805 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSNA1O43805 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSNA1O43805 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSNA1O43805 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSNA1O43805 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms