Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC25A20O43772 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC25A20O43772 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC25A20O43772 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC25A20O43772 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms