Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNGR3O43761 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGR3O43761 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGR3O43761 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNGR3O43761 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGR3O43761 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGR3O43761 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGR3O43761 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGR3O43761 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGR3O43761 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNGR3O43761 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNGR3O43761 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGR3O43761 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGR3O43761 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms