Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
STX6O43752 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
STX6O43752 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
STX6O43752 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
STX6O43752 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
STX6O43752 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
STX6O43752 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
STX6O43752 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
STX6O43752 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
STX6O43752 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
STX6O43752 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
STX6O43752 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
STX6O43752 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
STX6O43752 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
STX6O43752 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
STX6O43752 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
STX6O43752 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
STX6O43752 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
STX6O43752 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
STX6O43752 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
STX6O43752 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
STX6O43752 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
STX6O43752 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
STX6O43752 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
STX6O43752 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
STX6O43752 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
STX6O43752 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
STX6O43752 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
STX6O43752 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
STX6O43752 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
STX6O43752 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
STX6O43752 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
STX6O43752 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
STX6O43752 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
STX6O43752 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
STX6O43752 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
STX6O43752 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
STX6O43752 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
STX6O43752 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
STX6O43752 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
STX6O43752 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
STX6O43752 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
STX6O43752 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
STX6O43752 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
STX6O43752 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
STX6O43752 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
STX6O43752 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
STX6O43752 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
STX6O43752 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
STX6O43752 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
STX6O43752 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
STX6O43752 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
STX6O43752 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
STX6O43752 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
STX6O43752 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
STX6O43752 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
STX6O43752 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
STX6O43752 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
STX6O43752 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
STX6O43752 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
STX6O43752 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
STX6O43752 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
STX6O43752 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
STX6O43752 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
STX6O43752 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
STX6O43752 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
STX6O43752 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
STX6O43752 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
STX6O43752 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
STX6O43752 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
STX6O43752 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
STX6O43752 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
STX6O43752 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
STX6O43752 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
STX6O43752 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
STX6O43752 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
STX6O43752 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
STX6O43752 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
STX6O43752 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
STX6O43752 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
STX6O43752 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
STX6O43752 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
STX6O43752 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
STX6O43752 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
STX6O43752 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
STX6O43752 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
STX6O43752 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
STX6O43752 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
STX6O43752 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
STX6O43752 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
STX6O43752 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
STX6O43752 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
STX6O43752 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
STX6O43752 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
STX6O43752 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
STX6O43752 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
STX6O43752 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
STX6O43752 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
STX6O43752 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
STX6O43752 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms