Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ACTN4O43707 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ACTN4O43707 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ACTN4O43707 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ACTN4O43707 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ACTN4O43707 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ACTN4O43707 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ACTN4O43707 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ACTN4O43707 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ACTN4O43707 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ACTN4O43707 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ACTN4O43707 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ACTN4O43707 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ACTN4O43707 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ACTN4O43707 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ACTN4O43707 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ACTN4O43707 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ACTN4O43707 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ACTN4O43707 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ACTN4O43707 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ACTN4O43707 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ACTN4O43707 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ACTN4O43707 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ACTN4O43707 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ACTN4O43707 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ACTN4O43707 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ACTN4O43707 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ACTN4O43707 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ACTN4O43707 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ACTN4O43707 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ACTN4O43707 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ACTN4O43707 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ACTN4O43707 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ACTN4O43707 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ACTN4O43707 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ACTN4O43707 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ACTN4O43707 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ACTN4O43707 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ACTN4O43707 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ACTN4O43707 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ACTN4O43707 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ACTN4O43707 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ACTN4O43707 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ACTN4O43707 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ACTN4O43707 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ACTN4O43707 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ACTN4O43707 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ACTN4O43707 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ACTN4O43707 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ACTN4O43707 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ACTN4O43707 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ACTN4O43707 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ACTN4O43707 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ACTN4O43707 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ACTN4O43707 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ACTN4O43707 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ACTN4O43707 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ACTN4O43707 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ACTN4O43707 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ACTN4O43707 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ACTN4O43707 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ACTN4O43707 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ACTN4O43707 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ACTN4O43707 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ACTN4O43707 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ACTN4O43707 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ACTN4O43707 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ACTN4O43707 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms