Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARPC5O15511 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC5O15511 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARPC5O15511 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC5O15511 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC5O15511 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC5O15511 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC5O15511 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC5O15511 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC5O15511 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARPC5O15511 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC5O15511 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC5O15511 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC5O15511 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC5O15511 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC5O15511 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARPC5O15511 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARPC5O15511 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC5O15511 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC5O15511 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms