Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSC2O15499 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSC2O15499 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSC2O15499 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSC2O15499 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GSC2O15499 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSC2O15499 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GSC2O15499 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSC2O15499 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GSC2O15499 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSC2O15499 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GSC2O15499 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSC2O15499 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GSC2O15499 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GSC2O15499 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GSC2O15499 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GSC2O15499 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSC2O15499 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSC2O15499 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GSC2O15499 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GSC2O15499 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSC2O15499 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GSC2O15499 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSC2O15499 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSC2O15499 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GSC2O15499 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSC2O15499 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSC2O15499 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSC2O15499 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSC2O15499 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSC2O15499 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSC2O15499 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSC2O15499 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSC2O15499 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GSC2O15499 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSC2O15499 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSC2O15499 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSC2O15499 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSC2O15499 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSC2O15499 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSC2O15499 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSC2O15499 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSC2O15499 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSC2O15499 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSC2O15499 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSC2O15499 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSC2O15499 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSC2O15499 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSC2O15499 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSC2O15499 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSC2O15499 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSC2O15499 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GSC2O15499 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GSC2O15499 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSC2O15499 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GSC2O15499 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GSC2O15499 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GSC2O15499 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSC2O15499 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSC2O15499 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSC2O15499 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSC2O15499 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSC2O15499 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSC2O15499 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSC2O15499 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSC2O15499 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSC2O15499 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GSC2O15499 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSC2O15499 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSC2O15499 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSC2O15499 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSC2O15499 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSC2O15499 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSC2O15499 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSC2O15499 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
GSC2O15499 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSC2O15499 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSC2O15499 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSC2O15499 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSC2O15499 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSC2O15499 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSC2O15499 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GSC2O15499 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSC2O15499 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSC2O15499 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSC2O15499 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSC2O15499 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSC2O15499 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSC2O15499 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSC2O15499 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSC2O15499 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GSC2O15499 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSC2O15499 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSC2O15499 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSC2O15499 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSC2O15499 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSC2O15499 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSC2O15499 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSC2O15499 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSC2O15499 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms