Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDSPLO15194 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPLO15194 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTDSPLO15194 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTDSPLO15194 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTDSPLO15194 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTDSPLO15194 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms