Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CEP290O15078 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CEP290O15078 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CEP290O15078 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CEP290O15078 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CEP290O15078 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CEP290O15078 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CEP290O15078 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CEP290O15078 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP290O15078 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP290O15078 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CEP290O15078 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP290O15078 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CEP290O15078 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP290O15078 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CEP290O15078 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CEP290O15078 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP290O15078 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP290O15078 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CEP290O15078 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP290O15078 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CEP290O15078 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CEP290O15078 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP290O15078 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP290O15078 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP290O15078 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP290O15078 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CEP290O15078 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP290O15078 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP290O15078 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CEP290O15078 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP290O15078 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP290O15078 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP290O15078 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP290O15078 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP290O15078 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP290O15078 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP290O15078 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP290O15078 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CEP290O15078 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CEP290O15078 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP290O15078 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CEP290O15078 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CEP290O15078 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP290O15078 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP290O15078 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP290O15078 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP290O15078 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP290O15078 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP290O15078 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP290O15078 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP290O15078 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP290O15078 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP290O15078 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP290O15078 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP290O15078 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP290O15078 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP290O15078 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP290O15078 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP290O15078 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP290O15078 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP290O15078 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP290O15078 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP290O15078 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP290O15078 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP290O15078 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP290O15078 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP290O15078 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP290O15078 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP290O15078 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP290O15078 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP290O15078 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP290O15078 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP290O15078 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP290O15078 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP290O15078 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP290O15078 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP290O15078 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP290O15078 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP290O15078 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP290O15078 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP290O15078 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP290O15078 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP290O15078 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP290O15078 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CEP290O15078 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP290O15078 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP290O15078 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP290O15078 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP290O15078 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP290O15078 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP290O15078 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP290O15078 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CEP290O15078 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP290O15078 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP290O15078 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP290O15078 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP290O15078 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP290O15078 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP290O15078 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
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